Die im Ortsausschuss Muffendorf vertretenen Vereine können dessen Mitgliederliste entnommen werden. Zusätzlich gibt es zu folgenden Vereinen nähere Informationen:
Große Karnevalsgesellschaft Bergfunken e.V.
KG „Blau Gold“ 1966 Bad Godesberg Muffendorf e.V.
Juco e.V.
Peter-Schwingen-Gesellschaft Bonn – Bad Godesberg e.V.